郑成功去世后,郑经继承了父亲的职位。郑经达到台湾,继续执行父亲在台湾的政策,郑经为了保证粮食的生产,鼓励百姓大量开垦荒地,并且让手下的士兵和台湾当局的百姓一起进行劳作。除此之外,郑经在台湾设立了一套行政规则,并且效仿明清时期的朝廷在台湾设立六部,负责管理台湾当局的个中事务。郑经继承了父亲治理台湾的策略,在台湾设立学堂,鼓励百姓的子女免费入学。郑经启用陈永华作为政事处理顾问,陈永华在治理国家方面有很出色的才干,他建议郑经在台湾大范围内,多多开垦农田,进行庄稼的种植,陈永华了解台湾的作物生习性,建议郑经鼓励百姓大量种植甘蔗,进行蔗糖的生产。台湾四面环海,地理位置的优越带来了海产物的丰富,郑经在台湾沿海海域修建了堤坝,用于发展晒盐行业。并且,为了不让外敌入侵,郑经鼓励百姓在空闲时候,学习武术加以强身健体。在郑经的治理下,台湾各行业的发展蒸蒸日上,经济实力有了很大的提高。
1681年郑经去世后,次子郑克塽继承了父亲的爵位,后来归降清朝后,居住在北京直到去世。
郑成功的后人现今分布在日本、台湾和福建南安市石井镇。
台湾知名鱼类学家郑守让(原名郑明能)是郑成功第六子郑宽的后代,为郑成功九世孙。
诗人郑愁予(原名郑文韬)乃郑成功第十五代裔孙。
郑成功第十一代侄孙福住邦夫,是日本人。由此说明,也有不少郑氏子孙现生活在日本